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Google與加州大學合作，運用神經網路技術加速基因定序



Google了幾項他們運用最新機器學習技術，與其他學術單位和基因公司合作的研究結果，除了能夠更快地偵測遺傳性疾病之外，Google也開始投資公平性基因組學研究，要確保各種血統的人類個體，都能在最新技術中，獲得相同的準確度。


藉由基因定序，現代醫療能夠更好地了解、診斷和治療疾病，像是利用基因組定序來診斷罕見的遺傳性疾病，找出胸腺癌或是類動脈高壓等高風險人群，據估計，這些疾病影響大概8％的人口。


由於遺傳性疾病可能會導致嚴重的疾病，在許多情況下，及時發現存在的潛在風險，醫療能夠更早介入，提高挽回生命的可能性，對新生兒來說更是如此，遺傳性或是先天性疾病影響近6％的新生兒，但過去要辨識這些疾病的定序工作，需要數天到數周才能完成。


而現在Google與加州大學合作，運用遞迴神經網路開發一種稱為的方法，可以快速分析定序儀資料，成為目前最快的商業定序技術，這項技術已經被用在重症新生兒醫療上，辨識可疑的致病變異。在最快的情況下，不用8小時就能發現可能致病變異，而過去最快的時間需要13.5小時。目前這項技術已經成功反轉了一名嬰兒的神經發育障礙診斷結果，使醫療人員能及時針對疾病執行精確的治療。


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Google也與基因組定序平臺開發商PacBio合作，將機器學習和演算法開發工具用於定序資料，以獲得更多的資訊，Google開源一種名為DeepConsensus的方法，能夠與PacBio定序平臺結合，更準確地讀取定序資料，而這有助於研究人員將PacBio技術應用在更多元的用例中。


另外，與其他健康和醫學領域一樣，研究人員也努力解決基因組學領域中的公平性問題，Google提到，大多數基因組研究參與者，皆具有歐洲血統，如果不解決公平性問題，將會使研究結果出現偏差，也就是說研究成果可能不適用於不同血統的個體。


Google在過去一年資助了兩專案，針對代表性不足的人群，改進研究方法和基因組學資源。

來源鏈接：https://www.ithome.com.tw/news/148931


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